MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	TTG	2	6	665	670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058763
2	NC_021521	CAGA	2	8	671	678	50 %	0 %	25 %	25 %	514058763
3	NC_021521	GAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058763
4	NC_021521	T	6	6	828	833	0 %	100 %	0 %	0 %	514058763
5	NC_021521	TGT	2	6	907	912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058763
6	NC_021521	TTG	2	6	928	933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058763
7	NC_021521	AT	3	6	2258	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	514058764
8	NC_021521	AAT	2	6	2286	2291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058764
9	NC_021521	T	6	6	2369	2374	0 %	100 %	0 %	0 %	514058764
10	NC_021521	ATT	2	6	2378	2383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058764
11	NC_021521	AAG	2	6	2440	2445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058764
12	NC_021521	ATG	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058764
13	NC_021521	A	6	6	2628	2633	100 %	0 %	0 %	0 %	514058764
14	NC_021521	TGT	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
15	NC_021521	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058764
16	NC_021521	TGT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
17	NC_021521	ACTG	2	8	2738	2745	25 %	25 %	25 %	25 %	514058764
18	NC_021521	TCA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058764
19	NC_021521	ATG	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058764
20	NC_021521	CTA	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058764
21	NC_021521	ATTG	2	8	2951	2958	25 %	50 %	25 %	0 %	514058764
22	NC_021521	A	6	6	3013	3018	100 %	0 %	0 %	0 %	514058764
23	NC_021521	A	6	6	3072	3077	100 %	0 %	0 %	0 %	514058764
24	NC_021521	TTG	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
25	NC_021521	ATT	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058764
26	NC_021521	TTG	2	6	3205	3210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
27	NC_021521	CAG	2	6	3217	3222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058764
28	NC_021521	GGT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058765
29	NC_021521	GTTGGT	2	12	3873	3884	0 %	50 %	50 %	0 %	514058765
30	NC_021521	AGT	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058765
31	NC_021521	CG	3	6	4017	4022	0 %	0 %	50 %	50 %	514058765
32	NC_021521	TTC	2	6	4229	4234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058765
33	NC_021521	CAT	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058765
34	NC_021521	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058765
35	NC_021521	TGA	2	6	4303	4308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058765
36	NC_021521	GTC	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058765
37	NC_021521	TTC	2	6	4355	4360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058765
38	NC_021521	CAT	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058765
39	NC_021521	AATT	2	8	4466	4473	50 %	50 %	0 %	0 %	514058765
40	NC_021521	TTC	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058765
41	NC_021521	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058765
42	NC_021521	CAA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058765
43	NC_021521	GTT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058765
44	NC_021521	GTTAA	2	10	4911	4920	40 %	40 %	20 %	0 %	514058765
45	NC_021521	TGAA	2	8	4990	4997	50 %	25 %	25 %	0 %	514058765
46	NC_021521	CAC	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058765
47	NC_021521	T	7	7	5110	5116	0 %	100 %	0 %	0 %	514058765
48	NC_021521	AAG	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058765
49	NC_021521	AACGAC	2	12	5164	5175	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	514058765
50	NC_021521	ATA	2	6	5226	5231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058765
51	NC_021521	ACTC	2	8	5499	5506	25 %	25 %	0 %	50 %	514058766
52	NC_021521	A	6	6	5695	5700	100 %	0 %	0 %	0 %	514058766
53	NC_021521	GCAAA	2	10	5754	5763	60 %	0 %	20 %	20 %	514058766
54	NC_021521	A	6	6	5776	5781	100 %	0 %	0 %	0 %	514058766
55	NC_021521	CGG	2	6	5801	5806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058766
56	NC_021521	T	6	6	5827	5832	0 %	100 %	0 %	0 %	514058766
57	NC_021521	TTA	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058766
58	NC_021521	TGCCG	2	10	5892	5901	0 %	20 %	40 %	40 %	514058766
59	NC_021521	GAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058766
60	NC_021521	TGA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058766
61	NC_021521	TTTG	2	8	6189	6196	0 %	75 %	25 %	0 %	514058766
62	NC_021521	A	7	7	6320	6326	100 %	0 %	0 %	0 %	514058766
63	NC_021521	TTA	2	6	6340	6345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058766
64	NC_021521	AC	3	6	6365	6370	50 %	0 %	0 %	50 %	514058766
65	NC_021521	A	7	7	6371	6377	100 %	0 %	0 %	0 %	514058766
66	NC_021521	T	6	6	6414	6419	0 %	100 %	0 %	0 %	514058766
67	NC_021521	TGA	2	6	6455	6460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058766
68	NC_021521	GCA	2	6	6533	6538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058766
69	NC_021521	A	6	6	6586	6591	100 %	0 %	0 %	0 %	514058766
70	NC_021521	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058766
71	NC_021521	AAC	2	6	6704	6709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058766
72	NC_021521	G	10	10	6789	6798	0 %	0 %	100 %	0 %	514058766
73	NC_021521	TTG	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058767
74	NC_021521	ATTC	2	8	6948	6955	25 %	50 %	0 %	25 %	514058767
75	NC_021521	TTA	2	6	6978	6983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058767
76	NC_021521	CCG	2	6	7026	7031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058767
77	NC_021521	TTTA	2	8	7053	7060	25 %	75 %	0 %	0 %	514058767
78	NC_021521	ATT	2	6	7127	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058767
79	NC_021521	ATCA	2	8	7135	7142	50 %	25 %	0 %	25 %	514058767
80	NC_021521	TGA	2	6	7163	7168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058767
81	NC_021521	AGCA	2	8	7174	7181	50 %	0 %	25 %	25 %	514058767
82	NC_021521	GAAAA	2	10	7213	7222	80 %	0 %	20 %	0 %	514058767
83	NC_021521	AAG	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058767
84	NC_021521	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058767
85	NC_021521	TA	3	6	7299	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	514058767
86	NC_021521	A	6	6	7316	7321	100 %	0 %	0 %	0 %	514058767
87	NC_021521	AGAA	2	8	7534	7541	75 %	0 %	25 %	0 %	514058768
88	NC_021521	TA	3	6	7604	7609	50 %	50 %	0 %	0 %	514058768
89	NC_021521	AT	3	6	7635	7640	50 %	50 %	0 %	0 %	514058768
90	NC_021521	GAT	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058768
91	NC_021521	AAC	2	6	7669	7674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058768
92	NC_021521	ATCAA	2	10	7803	7812	60 %	20 %	0 %	20 %	514058769
93	NC_021521	TCTAA	2	10	7813	7822	40 %	40 %	0 %	20 %	514058769
94	NC_021521	ACT	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058769
95	NC_021521	AT	3	6	7902	7907	50 %	50 %	0 %	0 %	514058769
96	NC_021521	TGT	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058769
97	NC_021521	GTTT	2	8	8108	8115	0 %	75 %	25 %	0 %	514058769
98	NC_021521	ACA	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058769
99	NC_021521	CAC	2	6	8241	8246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058769
100	NC_021521	TGG	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058769
101	NC_021521	GAT	2	6	8329	8334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058769
102	NC_021521	A	6	6	8396	8401	100 %	0 %	0 %	0 %	514058769
103	NC_021521	GAC	2	6	8751	8756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058770
104	NC_021521	T	6	6	8811	8816	0 %	100 %	0 %	0 %	514058770
105	NC_021521	ATT	2	6	8875	8880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
106	NC_021521	A	6	6	8884	8889	100 %	0 %	0 %	0 %	514058770
107	NC_021521	TATC	2	8	8946	8953	25 %	50 %	0 %	25 %	514058770
108	NC_021521	TGT	2	6	8956	8961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058770
109	NC_021521	ATTT	2	8	8970	8977	25 %	75 %	0 %	0 %	514058770
110	NC_021521	A	6	6	8994	8999	100 %	0 %	0 %	0 %	514058770
111	NC_021521	CAG	2	6	9024	9029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058770
112	NC_021521	AAG	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
113	NC_021521	ATT	2	6	9175	9180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
114	NC_021521	AACC	2	8	9189	9196	50 %	0 %	0 %	50 %	514058770
115	NC_021521	AGA	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
116	NC_021521	T	7	7	9293	9299	0 %	100 %	0 %	0 %	514058770
117	NC_021521	TG	3	6	9361	9366	0 %	50 %	50 %	0 %	514058770
118	NC_021521	ATT	2	6	9372	9377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
119	NC_021521	TAA	2	6	9440	9445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
120	NC_021521	TGG	2	6	9454	9459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058770
121	NC_021521	TTA	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
122	NC_021521	GGC	2	6	9570	9575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058770
123	NC_021521	TAA	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
124	NC_021521	AGA	2	6	9659	9664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
125	NC_021521	TGA	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
126	NC_021521	CAC	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058770
127	NC_021521	GTT	2	6	9749	9754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058770
128	NC_021521	ATT	2	6	9757	9762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
129	NC_021521	AG	3	6	9797	9802	50 %	0 %	50 %	0 %	514058770
130	NC_021521	TGA	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
131	NC_021521	TGT	2	6	9868	9873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058770
132	NC_021521	CAA	2	6	9882	9887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
133	NC_021521	TTTG	2	8	9893	9900	0 %	75 %	25 %	0 %	514058770
134	NC_021521	AAC	2	6	9901	9906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
135	NC_021521	GGAAT	2	10	9923	9932	40 %	20 %	40 %	0 %	514058770
136	NC_021521	AAAG	2	8	9972	9979	75 %	0 %	25 %	0 %	514058770
137	NC_021521	TAA	2	6	9980	9985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
138	NC_021521	AGA	2	6	9992	9997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
139	NC_021521	CTTT	2	8	10045	10052	0 %	75 %	0 %	25 %	514058770
140	NC_021521	AATC	2	8	10056	10063	50 %	25 %	0 %	25 %	514058770
141	NC_021521	A	6	6	10073	10078	100 %	0 %	0 %	0 %	514058770
142	NC_021521	AAT	2	6	10125	10130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
143	NC_021521	CT	3	6	10164	10169	0 %	50 %	0 %	50 %	514058770
144	NC_021521	A	7	7	10260	10266	100 %	0 %	0 %	0 %	514058770
145	NC_021521	ATT	2	6	10548	10553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
146	NC_021521	GCGTG	2	10	10565	10574	0 %	20 %	60 %	20 %	514058770
147	NC_021521	TGCC	2	8	10777	10784	0 %	25 %	25 %	50 %	514058770
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149	NC_021521	CCA	2	6	10954	10959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058770
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151	NC_021521	T	7	7	11030	11036	0 %	100 %	0 %	0 %	514058770
152	NC_021521	GCG	2	6	11169	11174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058770
153	NC_021521	GCA	2	6	11207	11212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058770
154	NC_021521	AAC	2	6	11383	11388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
155	NC_021521	TGG	2	6	11447	11452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058770
156	NC_021521	TGCT	2	8	11507	11514	0 %	50 %	25 %	25 %	514058770
157	NC_021521	TGC	2	6	11663	11668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058770
158	NC_021521	TTGA	2	8	11769	11776	25 %	50 %	25 %	0 %	514058770
159	NC_021521	AAC	2	6	11936	11941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
160	NC_021521	TTTA	2	8	11966	11973	25 %	75 %	0 %	0 %	514058770
161	NC_021521	GAT	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
162	NC_021521	GTG	2	6	12026	12031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058770
163	NC_021521	CTTTGC	2	12	12331	12342	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	514058771
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166	NC_021521	CA	3	6	12383	12388	50 %	0 %	0 %	50 %	514058771
167	NC_021521	CA	3	6	12416	12421	50 %	0 %	0 %	50 %	514058771
168	NC_021521	AAG	2	6	12445	12450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058771
169	NC_021521	ATT	2	6	12454	12459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058771
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171	NC_021521	TTAA	2	8	12522	12529	50 %	50 %	0 %	0 %	514058771
172	NC_021521	TAA	2	6	12554	12559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058771
173	NC_021521	AAG	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058771
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177	NC_021521	CAA	2	6	12915	12920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058771
178	NC_021521	ATG	2	6	13008	13013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058771
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187	NC_021521	TTG	2	6	13526	13531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058772
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199	NC_021521	TGA	2	6	13930	13935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
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223	NC_021521	TGA	2	6	15202	15207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
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244	NC_021521	TGAC	2	8	16544	16551	25 %	25 %	25 %	25 %	514058773
245	NC_021521	AGT	2	6	16572	16577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058773
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247	NC_021521	ATT	2	6	16644	16649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058773
248	NC_021521	CTT	2	6	16668	16673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058773
249	NC_021521	TGAA	2	8	16733	16740	50 %	25 %	25 %	0 %	514058773
250	NC_021521	A	6	6	16777	16782	100 %	0 %	0 %	0 %	514058773
251	NC_021521	ACT	2	6	16893	16898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058774
252	NC_021521	AAG	2	6	16934	16939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058774
253	NC_021521	CATT	2	8	17019	17026	25 %	50 %	0 %	25 %	514058774
254	NC_021521	TGAAT	2	10	17115	17124	40 %	40 %	20 %	0 %	514058774
255	NC_021521	TGG	2	6	17139	17144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058774
256	NC_021521	TGG	2	6	17168	17173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058774
257	NC_021521	TGA	2	6	17190	17195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058774
258	NC_021521	TTG	2	6	17285	17290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058774
259	NC_021521	ACA	2	6	17320	17325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058774
260	NC_021521	TC	3	6	17384	17389	0 %	50 %	0 %	50 %	514058774
261	NC_021521	AGC	2	6	17457	17462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058774
262	NC_021521	TG	3	6	17469	17474	0 %	50 %	50 %	0 %	514058774
263	NC_021521	T	6	6	17516	17521	0 %	100 %	0 %	0 %	514058774
264	NC_021521	CTAAGG	2	12	17573	17584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514058774
265	NC_021521	A	6	6	17599	17604	100 %	0 %	0 %	0 %	514058774
266	NC_021521	AAT	2	6	17973	17978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058775
267	NC_021521	CGA	2	6	18034	18039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058775
268	NC_021521	AGT	2	6	18053	18058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058775
269	NC_021521	TAT	2	6	18107	18112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058775
270	NC_021521	ACC	2	6	18168	18173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058775
271	NC_021521	CAG	2	6	18227	18232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058775
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273	NC_021521	AAT	2	6	18513	18518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058775
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287	NC_021521	TAG	2	6	19188	19193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058776
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290	NC_021521	CAC	2	6	19311	19316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058776
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299	NC_021521	TAATC	2	10	19682	19691	40 %	40 %	0 %	20 %	514058776
300	NC_021521	T	6	6	19763	19768	0 %	100 %	0 %	0 %	514058777
301	NC_021521	TTG	2	6	19824	19829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058777
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393	NC_021521	TCGCAT	2	12	26054	26065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514058783
394	NC_021521	ATA	2	6	26104	26109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058783
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